RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 PMS2P11Q13670 270 aa15.2■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 RXFP4Q8TDU9 374 aa15.2■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa15.2■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 A0A0U1RQK1 487 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 BCL2P10415 239 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 RND2P52198 227 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 MEGF9Q9H1U4 602 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 RNF223E7ERA6 249 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 MT-CO2P00403 227 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 AVPP01185 164 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 IFNA1P01562 189 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 NDPQ00604 133 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 Q5PR19 223 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 THAP8Q8NA92 274 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 RASL11BQ9BPW5 248 aa15.19■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 ZFHX3Q15911 3703 aa15.18■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 HLA-DRB1P01911 266 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 RHOBP62745 196 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 IQCF2Q8IXL9 164 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 TMEM116Q8NCL8 245 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 C22orf15Q8WYQ4 148 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 FBP1P09467 338 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 ASPHD1Q5U4P2 390 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 MBD6Q96DN6 1003 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 VAX2Q9UIW0 290 aa15.17■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 NPIPB5A8MRT5 1133 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 I3L2K1 104 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 TGFAP01135 160 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 STAG3L2P0CL84 134 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 STAG3L3P0CL85 134 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 ZNF90Q03938 601 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 PIFOQ8TCI5 191 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 ABCA1O95477 2261 aa15.16■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 TSPAN9O75954 239 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 TTC9CQ8N5M4 171 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SNAPINO95295 136 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 PSMB3P49720 205 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SELENOTP62341 195 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 FAM78BQ5VT40 261 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 SSX3Q99909 188 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 HSPB9Q9BQS6 159 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 C19orf24Q9BVV8 132 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 MANBALQ9NQG1 85 aa15.15■□□□□ 0.02
UPP1-201ENST00000331803 J3QLI3 93 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 CXorf1O96002 111 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 ARL14EPLP0DKL9 152 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 CEBPGP53567 150 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 BTN1A1Q13410 526 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 PRSS57Q6UWY2 283 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 TNFRSF19Q9NS68 423 aa15.14■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 TMEM219Q86XT9 240 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 C5orf56Q8N8D9 126 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 Q96MF0 132 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 TRGV9Q99603 122 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 FUT9Q9Y231 359 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 K7EIM0 57 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 TMEM37Q8WXS4 190 aa15.13■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 MIR17HGQ75NE6 70 aa15.12■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.12■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 OR4X1Q8NH49 305 aa15.12■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 NANPQ8TBE9 248 aa15.12■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 FANCD2OSQ96PS1 177 aa15.12■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa15.12■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.11■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 PSMB11A5LHX3 300 aa15.11■□□□□ 0.01
UPP1-201ENST00000331803 PAGE4O60829 102 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms