RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM229AH3BQW9 127 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 I3L2K1 104 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PPYP01298 95 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA5P01569 189 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HSMCR30P0CW71 290 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 F2RP25116 425 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FXYD4P59646 89 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HERV-K104P61576 105 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 RRN3P1Q2M238 152 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT8Q8NBV8 401 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF114Q8NC26 417 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4A16Q8NH70 328 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 DCANP1Q8TF63 244 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPQ1 181 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 IFITM5A6NNB3 132 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT3O95989 172 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 KRASP01116 189 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYBB3P26998 211 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ID1P41134 155 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 Q5VSD8 79 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 BEST4Q8NFU0 473 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 AGRNO00468 2067 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LYRM9A8MSI8 78 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BMM0 161 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DRB4P13762 266 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB3BP20337 219 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 B2MP61769 119 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM17Q86X19 198 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRB2Q8N423 598 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8WTZ3 238 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 GPHA2Q96T91 129 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 GFI1Q99684 422 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NRN1Q9NPD7 142 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NACAE9PAV3 2078 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM235A6NFC5 223 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGES3LE9PB15 166 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM50AO95807 157 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 G6PCP35575 357 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LPAR6P43657 344 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 CBX5P45973 191 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA13P48723 471 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVFC1-1P60608 527 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PRCDQ00LT1 54 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 COQ8AQ8NI60 647 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 VCXQ9H320 206 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9H8V8 135 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A14Q9HCY8 104 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ENY2Q9NPA8 101 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NSG2Q9Y328 171 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HERC1Q15751 4861 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GU03 582 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 F5H768 121 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 M0QYG6 137 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 CLN5O75503 358 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG12O94817 140 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-48P01763 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 RLN1P04808 185 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5G1P05496 136 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms