RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 UPK2O00526 184 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPP1R17O96001 155 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00271P0C7V0 271 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRAP2Q96G30 205 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNFSF13O75888 250 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV1D-33P01593 117 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV1-33P01594 117 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 IQCF6A8MYZ5 107 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 EPDR1Q9UM22 224 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 SBF2Q86WG5 1849 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC01551Q86U37 167 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC01560Q8TB33 94 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PRE2 83 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 TSPAN13O95857 204 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 CACNG7P62955 275 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLEC2AQ6UVW9 174 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 LEPP41159 167 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 TREML4Q6UXN2 200 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 BMPERQ8N8U9 685 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 GDF15Q99988 308 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 DPM3Q9P2X0 92 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 TM4SF5O14894 197 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 CEACAM4O75871 244 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 RRN3P1Q2M238 152 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 GP6Q9HCN6 339 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 YPEL1O60688 119 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 LCN12Q6JVE5 192 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 YPEL2Q96QA6 119 aa11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC10-201ENST00000291574 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 C9JQL5 133 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRYGSP22914 178 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 MTURNQ8N3F0 131 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 TSPOP30536 169 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6AWC8 147 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 DOCK6Q96HP0 2047 aa11.33□□□□□ -0.6
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SIPA1L1O43166 1804 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 LCTP09848 1927 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 DLEU1O43261 78 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 PATJQ8NI35 1801 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNAL4O96015 105 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 CD24P25063 80 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 CD69Q07108 199 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHODLQ9H9P2 273 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM50AO95807 157 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LHX2P50458 406 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRAPPC10-201ENST00000291574 NMSQ5H8A3 153 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ASIPP42127 132 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF664Q8N3J9 261 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 STAG3L3P0CL85 134 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 GZMBP10144 247 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 30.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV1-5P01602 117 aa11.32□□□□□ -0.6
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.31□□□□□ -0.6
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