RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000006071.13

Otx1-201, Transcript of Homeobox protein OTX1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Otx1, Length 2,789 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm5447Q8BPB2 115 aa11.02□□□□□ -0.64
Otx1-201ENSMUST00000006071 Hist1h2bkQ8CGP1 126 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
Otx1-201ENSMUST00000006071 Hist1h2bpQ8CGP2 126 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
Otx1-201ENSMUST00000006071 Golt1aQ9DCQ3 133 aa11.02□□□□□ -0.64
Otx1-201ENSMUST00000006071 StrapQ9Z1Z2 350 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
Otx1-201ENSMUST00000006071 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Igkv13-85A0A075B666 115 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm29049A0A087WSM5 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 B1ARW8 110 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Adam6aB2RSY5 754 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 9130204L05RikG3UWB8 92 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm21118J3QPK8 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Mtco2P00405 227 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Hbb-yP02104 147 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Defa-rs12P50716 91 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Rab1AP62821 205 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Mcrip1Q3UGS4 97 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm20909Q5FWB5 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm20852Q5M8R5 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm12253Q5NC48 229 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm20917Q62457 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm20809Q62458 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm20865Q62460 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Iqcf4Q6P8Y2 204 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr1341Q7TQV4 312 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr305Q7TS02 319 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm20738Q810R8 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Fam110aQ8R184 296 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr1408Q8VG32 310 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Pdzd11Q9CZG9 140 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm20806Q9D9T3 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Kcnip1Q9JJ57 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm6880A3KG45 208 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Vmn1r113G3UWI8 307 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Scgb1b3J3QJY4 93 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Slc7a15Q50E62 488 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Klf3Q60980 344 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gpank1Q61858 372 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Ypel4Q65Z93 127 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 FarsaQ8C0C7 508 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr482Q8VG03 323 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Nxph3Q91VX5 252 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Egln1Q91YE3 400 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 RhebQ921J2 184 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Scrt1Q99M85 348 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Srp19Q9D7A6 144 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Plekha2Q9ERS5 425 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm11027G8JL69 66 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 H2-M10.1O19443 331 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Ccr2P51683 373 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Rbpms2Q8VC52 206 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr1368Q8VFG3 314 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr435Q8VFS3 313 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr980Q8VH08 310 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Q9CQT9 129 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Tmem50aQ9CXL1 157 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Cnn3Q9DAW9 330 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Dock10Q8BZN6 2150 aa11.01□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Rps2-ps6A0A140T8L5 221 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr204E9Q8M0 305 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gm21863J3KMP8 111 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Vdac2Q60930 295 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Utf1Q6J1H4 339 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Abhd17bQ7M759 288 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Ifna14Q810G3 189 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 H2-M10.3Q85ZW6 330 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Fam234aQ8C0Z1 555 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Tmem19Q91W52 336 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Errfi1Q99JZ7 461 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 9130008F23RikQ9D2Z6 181 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Q9DAL9 119 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Wipf3P0C7L0 485 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Cox5aP12787 146 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Fgf12P61329 243 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Lrrc30Q3UV48 300 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Cd200r4Q6XJV4 270 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr1137Q7TR40 310 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr193Q7TS43 309 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Vmn1r233Q8R294 319 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 MrgprfQ8VCJ6 343 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Tmem100Q9CQG9 134 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Msmo1Q9CRA4 293 aa11□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Trbv29A0A0G2LB96 114 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 2010315B03RikJ3QK55 433 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Pitx3O35160 302 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 GzmaP11032 260 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 GrnP28798 589 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Mas1P30554 324 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 CamlgP49070 294 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Rbp2Q08652 134 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 SlaQ60898 281 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Olfr987Q7TRA2 309 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Nadk2Q8C5H8 452 aa10.99□□□□□ -0.65
Otx1-201ENSMUST00000006071 Gkn3Q9D0T7 191 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.8 ms