RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 TCRBP04435 133 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4E1P0C645 316 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 ZP3P21754 424 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.65□□□□□ -1.02
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CCL3L3-201ENST00000612839 PFDN1O60925 122 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 SAP30O75446 220 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 MT-CO2P00403 227 aa8.64□□□□□ -1.03
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CCL3L3-201ENST00000612839 MITD1Q8WV92 249 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 NEURL2Q9BR09 285 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ALG5Q9Y673 324 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2T8A6NH00 312 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 CORTO00230 105 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 TGOLN2O43493 480 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-48P01763 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 HTR2BP41595 481 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 GPHB5Q86YW7 130 aa8.63□□□□□ -1.03
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