RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 CCSO14618 274 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 C15orf32Q32M92 178 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 RNF152Q8N8N0 203 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 RNF125Q96EQ8 232 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 NABP2Q9BQ15 211 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SVILO95425 2214 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 A0A1B0GWJ7 208 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 A0A1W2PPQ1 181 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 PSCAO43653 123 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 VENTXO95231 258 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 DANCRP0C864 163 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 DYNLT3P51808 116 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 CACNG7P62955 275 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 UQCC3Q6UW78 93 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 BAGE2Q86Y30 109 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 STPG2Q8N412 459 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 GPR146Q96CH1 333 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TVP23CQ96ET8 276 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 B4DEV8 164 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 H0YJW9 148 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 MLNRO43193 412 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 BAGE3Q86Y29 109 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 VAX2Q9UIW0 290 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 CCL24O00175 119 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 DLX1P56177 255 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 RAB32Q13637 225 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM187Q14656 261 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 ARTNQ5T4W7 220 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 KIR2DL4Q99706 377 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 CXorf65A6NEN9 183 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 CIDEAO60543 219 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 FGFBP3Q8TAT2 258 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 LEAP2Q969E1 77 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 FAM210BQ96KR6 192 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SGK494Q96LW2 274 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TRGV9Q99603 122 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 CTF1Q16619 201 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 OTORQ9NRC9 128 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 RFNGQ9Y644 331 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 MGPP08493 103 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 NDUFA6P56556 154 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 LYZL4Q96KX0 146 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 FAM74A7A6NL05 159 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 NDUFA7O95182 113 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 KLRD1Q13241 179 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SPINK9Q5DT21 86 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM219Q86XT9 240 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 SHISA3A0PJX4 238 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 CRLF1O75462 422 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 APELAP0DMC3 54 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 PMCHP20382 165 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 PSMG4Q5JS54 123 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 FMC1Q96HJ9 113 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 NAT8Q9UHE5 227 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-212ENST00000591126 APOC3P02656 99 aa5.12□□□□□ -1.59
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