RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 CIAO1O76071 339 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 IFNA7P01567 189 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SERPINB1P30740 379 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 EVX1P49640 407 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 NCALDP61601 193 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF90Q03938 601 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 HCP5Q6MZN7 132 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 STX19Q8N4C7 294 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 OR51T1Q8NGJ9 327 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 IMUPQ9GZP8 106 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TOPBP1Q92547 1522 aa2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 DNMBPQ6XZF7 1577 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TRAV41A0A0B4J266 112 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SIGLEC16A6NMB1 481 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 H0YJX3 145 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 H7C1C5 153 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP5G3P48201 142 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 LCN6P62502 163 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 GRINAQ7Z429 371 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 CHST6Q9GZX3 395 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SSR3Q9UNL2 185 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 LCTP09848 1927 aa2.7□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 FMN1Q68DA7 1419 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TRAPPC2LH3BP13 241 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 IDO1P14902 403 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 PIGPP57054 158 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 DEFA3P59666 94 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 CDC42P60953 191 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 RHOBP62745 196 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 GNG5P63218 68 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 LCA10Q71F78 164 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 Q8NDZ9 215 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TERB2Q8NHR7 220 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 GPER1Q99527 375 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ACER3Q9NUN7 267 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ERGIC3Q9Y282 383 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SIPA1L1O43166 1804 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 GAPVD1Q14C86 1478 aa2.69□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 EEA1Q15075 1411 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 MIA2Q96PC5 1412 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 NOTCH2Q04721 2471 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 CUX1P39880 1505 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 CLDN25C9JDP6 229 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 FXYD2P54710 66 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 AKAP14Q86UN6 197 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 C11orf40Q8WZ69 217 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 PBDC1Q9BVG4 233 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 DDA1Q9BW61 102 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 PBOV1Q9GZY1 135 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TONSLQ96HA7 1378 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TOP2BQ02880 1626 aa2.68□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 H3BQV1 296 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 CBR1P16152 277 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ARPC4P59998 168 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TNFRSF9Q07011 255 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 RHEBQ15382 184 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 KISS1Q15726 138 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAJC9Q8WXX5 260 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM106AQ96A25 262 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 MALSU1Q96EH3 234 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 MED29Q9NX70 200 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SLIT2O94813 1529 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 ATG2BQ96BY7 2078 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 FHAD1B1AJZ9 1412 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa2.67□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SYNMO15061 1565 aa2.66□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.66□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.66□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 MFSD11O43934 449 aa2.66□□□□□ -1.98
PIK3C3-211ENST00000589550 IFNA21P01568 189 aa2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms