RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587586.5

GTF3C2-AS1-204, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 529 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SLC25A4P12235 298 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RAP2BP61225 183 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SLC35B1P78383 322 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ARL16Q0P5N6 197 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ECSCRQ19T08 205 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TMEM65Q6PI78 240 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NECAP1Q8NC96 275 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 USMG5Q96IX5 58 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ATP6V0BQ99437 205 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NEURL2Q9BR09 285 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PDCD10Q9BUL8 212 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HINT2Q9BX68 163 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 OR5AC2Q9NZP5 309 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM223BA6NKX1 122 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM25EA8MYX2 175 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CCNKO75909 580 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 OR2J3O76001 311 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TRGV3P03979 118 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IAPPP10997 89 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SNCAP37840 140 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 P2RY1P47900 373 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RHOGP84095 191 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MS4A10Q96PG2 267 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TXN2Q99757 166 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PSENENQ9NZ42 101 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 A0A0G2JLM5 398 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IGSF23A1L1A6 192 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 E5RGE8 158 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FNDC10F2Z333 226 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CORTO00230 105 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SSSCA1O60232 199 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MT-CO2P00403 227 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CTSGP08311 255 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PF4V1P10720 104 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NPY1RP25929 384 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ATP5G2Q06055 141 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CD69Q07108 199 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CD300CQ08708 224 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FGL1Q08830 312 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FHL3Q13643 280 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 VWC2Q2TAL6 325 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NOXA1Q86UR1 476 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CACNG8Q8WXS5 425 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CCDC140Q96MF4 163 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GNB4Q9HAV0 340 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ENY2Q9NPA8 101 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RNF222A6NCQ9 220 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HMSDA8MTL9 139 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 H3BP45 60 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SCGB1D2O95969 90 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IFNA10P01566 189 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RLN2P04090 185 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DEFA4P12838 97 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ADMP35318 185 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms