RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568670.5

FANCI-215, Transcript of FA complementation group I, human

TSL 3

Gene FANCI, Length 285 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FANCI-215	ENST00000568670	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ICAM4	Q14773	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	OXA1L	Q15070	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	NEU1	Q99519	415 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670		Q9H8V8	135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670		A0A1W2PS18	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670		F5H768	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	SULT1C2	O00338	296 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	SLC17A2	O00624	439 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	EREG	O14944	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	MT-CO2	P00403	227 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	NQO2	P16083	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	NPPC	P23582	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	GADD45A	P24522	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	P2RY1	P47900	373 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	RAB11B	Q15907	218 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	SSX1	Q16384	188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	MLANA	Q16655	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	GFI1	Q99684	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670		H3BMM0	161 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670		I3L2K1	104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	MYL12B	O14950	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	HPRT1	P00492	218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	HBE1	P02100	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	GNRHR	P30968	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	PPP5C	P53041	499 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	TAS2R31	P59538	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	DEFB1	P60022	68 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	TXN2	Q99757	166 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670		Q9H3A6	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670		A0A1B0GU03	582 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	MFNG	O00587	321 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	CD1A	P06126	327 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	WNT4	P56705	351 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	LINC00315	P59091	139 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ERVK-16	P61578	105 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	HES5	Q5TA89	166 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FANCI-215	ENST00000568670	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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