RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ZNF616Q08AN1 781 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 PLA2G7Q13093 441 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 UBE2V1Q13404 147 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 CASC10Q5T4H9 136 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 LINC01551Q86U37 167 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ZNF429Q86V71 674 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 OR11H1Q8NG94 326 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 GHSRQ92847 366 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 TMEM18Q96B42 140 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SMIM19Q96E16 107 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 YPEL4Q96NS1 127 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 KLK15Q9H2R5 256 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 GNB4Q9HAV0 340 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 VSIG4Q9Y279 399 aa6.51□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SORL1Q92673 2214 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 OR5H14A6NHG9 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 M0R036 132 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 GOSR2O14653 212 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BKO60814 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ARL6IP5O75915 188 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HBZP02008 142 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BJP06899 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 FCGR3AP08637 254 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 FABP4P15090 132 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SRMP19623 302 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SERPINA2P20848 420 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BOP23527 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 OR10J1P30954 320 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BBP33778 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BDP58876 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BCP62807 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 GNB1P62873 340 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 MMDQ15546 238 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SLC35G3Q8N808 338 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 NPBQ8NG41 125 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 UBALD1Q8TB05 177 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ASCL2Q99929 193 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 GNG12Q9UBI6 72 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SMPXQ9UHP9 88 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 NAGKQ9UJ70 344 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 JPT1Q9UK76 154 aa6.5□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 G3V318 75 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ATP6V0E1O15342 81 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 CYB5BO43169 146 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SOX15O60248 233 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 PET100P0DJ07 73 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SNCAP37840 140 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 RAB9AP51151 201 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 H2BFSP57053 126 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 NDPQ00604 133 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 OR5I1Q13606 314 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 Q499Y3 187 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 MORN2Q502X0 79 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.49□□□□□ -1.37
PALB2-202ENST00000561514 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.49□□□□□ -1.37
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