RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 G3V318 75 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 K7EPK0 472 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 M0QZ24 198 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 PITX3O75364 302 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 CCNKO75909 580 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 BRI3O95415 125 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 CRYGCP07315 174 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 CTRB1P17538 263 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 RAB9AP51151 201 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 MFAP4P55083 255 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 RHOGP84095 191 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 FCN2Q15485 313 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 Q56UQ5 140 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 ACSM6Q6P461 480 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 Q6ZRM9 215 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 LILRB2Q8N423 598 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 OR4F4Q96R69 305 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 GNG7O60262 68 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 PFDN1O60925 122 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 DEDDO75618 318 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 SIX6O95475 246 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 PF4P02776 101 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 AREGP15514 252 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 S100A11P31949 105 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 P2RY1P47900 373 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 NDPQ00604 133 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 CD83Q01151 205 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 BAXQ07812 192 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 RAB32Q13637 225 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 C15orf32Q32M92 178 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 C2orf83Q53S99 150 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 Q6ZNX1 250 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 ATP6V0BQ99437 205 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 TXN2Q99757 166 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 GNB4Q9HAV0 340 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 SMCO3A2RU48 225 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 MPTX1A8MV57 137 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 OR2J3O76001 311 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 DFFBO76075 338 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 MPC2O95563 127 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 IGLV1-40P01703 118 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 ZP3P21754 424 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 PSMB8P28062 276 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 BMI1P35226 326 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 PROK1P58294 105 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 AKR1C1Q04828 323 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 WT1-ASQ06250 92 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 ATP6V1FQ16864 119 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 ZNF709Q8N972 641 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 P2RX4Q99571 388 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 GGACTQ9BVM4 153 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 RNF24Q9Y225 148 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 RYR2Q92736 4967 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-218ENST00000550159 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 LINC01548A6NM66 108 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 H3BP45 60 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 IFNA5P01569 189 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 MYOD1P15172 320 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 SULT1A1P50225 295 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 H2BFSP57053 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 RPEL1Q2QD12 228 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-218ENST00000550159 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms