RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	PGAM2	P15259	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TAS2R19	P59542	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	RND3	P61587	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ODF1	Q14990	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474		S4R3C0	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TNC	P24821	2201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474		K7EMT4	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CORT	O00230	105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	NDUFA4	O00483	81 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TSPAN4	O14817	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CD74	P04233	296 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CD7	P09564	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	PIGP	P57054	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MEF2D	Q14814	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474		Q56UQ5	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CT83	Q5H943	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TXN2	Q99757	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MLX	Q9UH92	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474		K7EIM0	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474		M0QYG6	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RGS5	O15539	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RAB3D	O95716	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CD3D	P04234	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CD5	P06127	495 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	BMI1	P35226	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SNCA	P37840	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	AKR1C2	P52895	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	MFAP2	P55001	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TMBIM6	P55061	237 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	MFAP4	P55083	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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