RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532433.5

TATDN3-215, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene TATDN3, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-215ENST00000532433 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.72□□□□□ -1.33
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TATDN3-215ENST00000532433 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.72□□□□□ -1.33
TATDN3-215ENST00000532433 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.72□□□□□ -1.33
TATDN3-215ENST00000532433 MIFP14174 115 aa6.72□□□□□ -1.33
TATDN3-215ENST00000532433 FCGR2CP31995 323 aa6.72□□□□□ -1.33
TATDN3-215ENST00000532433 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TATDN3-215ENST00000532433 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TATDN3-215ENST00000532433 Q8N1X5 172 aa6.72□□□□□ -1.33
TATDN3-215ENST00000532433 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.72□□□□□ -1.33
TATDN3-215ENST00000532433 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.72□□□□□ -1.33
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TATDN3-215ENST00000532433 IGKV1D-39P04432 117 aa6.71□□□□□ -1.34
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TATDN3-215ENST00000532433 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.68□□□□□ -1.34
TATDN3-215ENST00000532433 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TATDN3-215ENST00000532433 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.68□□□□□ -1.34
TATDN3-215ENST00000532433 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
TATDN3-215ENST00000532433 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.67□□□□□ -1.34
TATDN3-215ENST00000532433 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.67□□□□□ -1.34
TATDN3-215ENST00000532433 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TATDN3-215ENST00000532433 KRASP01116 189 aa6.67□□□□□ -1.34
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