RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPAN9O75954 239 aa6.67□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PF4V1P10720 104 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C4BPBP20851 252 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OPRK1P41145 380 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MLANAQ16655 118 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP6V1FQ16864 119 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.67□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THYN1Q9P016 225 aa6.67□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.67□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAAR5O14804 337 aa6.66□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DFFBO76075 338 aa6.66□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNA5P01569 189 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-48P01763 117 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRGV3P03979 118 aa6.66□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP5G2Q06055 141 aa6.66□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.66□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.66□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35E1Q96K37 410 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.66□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF580Q9UK33 172 aa6.66□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACANP16112 2415 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.65□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFHR3Q02985 330 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKR1C1Q04828 323 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD69Q07108 199 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX38Q6PEX7 206 aa6.65□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP5SQ99766 215 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GGACTQ9BVM4 153 aa6.65□□□□□ -1.34
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIVEP2P31629 2446 aa6.65□□□□□ -1.35
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM89A2RUT3 159 aa6.64□□□□□ -1.35
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-23P01764 117 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHG4P01861 327 aa6.64□□□□□ -1.35
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXE3Q13461 319 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAMTQ14353 236 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C15orf32Q32M92 178 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q56UQ5 140 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC01006Q8NI28 216 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPIPB3Q92617 1050 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLK15Q9H2R5 256 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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