RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 LINC00869P0C866 280 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 OR13C7P0DN81 318 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 GATA3P23771 443 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 PAX6P26367 422 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 MFAP2P55001 183 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 PRR20EP86478 221 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 PRR20CP86479 221 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 PRR20DP86480 221 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 PRR20BP86481 221 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 PRR20AP86496 221 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 CD69Q07108 199 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 GAMTQ14353 236 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 TNXAQ16473 311 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 MLANAQ16655 118 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM249Q2WGJ8 235 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 KLK9Q2XQG4 91 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF709Q8N972 641 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 LFNGQ8NES3 379 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.65□□□□□ -1.5
UBASH3B-203ENST00000526386 COL6A5A8TX70 2615 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 VPS13CQ709C8 3753 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 AREGP15514 252 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 M6PRP20645 277 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 CD24P25063 80 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 BRS3P32247 399 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 RAB2AP61019 212 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF616Q08AN1 781 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 HNF4GQ14541 408 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 MMDQ15546 238 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 TEPPQ6URK8 271 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 SSX7Q7RTT5 188 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 Q8N9W7 124 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 THAP8Q8NA92 274 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 OR1P1Q8NH06 330 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 PIFOQ8TCI5 191 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 KIAA1456Q9P272 454 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 J3QLI3 93 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 AGPAT2O15120 278 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 ACTL6BO94805 426 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 AVPP01185 164 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM106CPP0CH98 169 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 CTRB1P17538 263 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 CX3CL1P78423 397 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 RAB31Q13636 194 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 FXYD3Q14802 87 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 PEA15Q15121 130 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 GUK1Q16774 197 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 ZANQ9Y493 2812 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 HIVEP2P31629 2446 aa5.63□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 SMCO3A2RU48 225 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 I3L2K1 104 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 CYB5BO43169 146 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 TSPAN9O75954 239 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 FSHBP01225 129 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-203ENST00000526386 HLA-DRB1P01911 266 aa5.62□□□□□ -1.51
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