RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 PCDH15Q96QU1 1955 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TRANK1O15050 2925 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 RP1P56715 2156 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CD300LBA8K4G0 201 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 G3V3Y1 287 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 H3BP45 60 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 H7BYZ3 331 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SYNGR1O43759 233 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP5-8O75690 187 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GCGP01275 180 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1D-33P01593 117 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1-33P01594 117 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 HLA-HP01893 362 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 P04436 131 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GZMBP10144 247 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 IAPPP10997 89 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 FABP4P15090 132 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GALR1P47211 349 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 LHX2P50458 406 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GPM6AP51674 278 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SPCS3P61009 180 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GNG3P63215 75 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF9Q07011 255 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 BSXQ3C1V8 233 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 LCN15Q6UWW0 184 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SSX9Q7RTT3 188 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR51H1Q8NH63 302 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 ABHD3Q8WU67 409 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 PSMF1Q92530 271 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 RAB1CQ92928 201 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR4C12Q96R67 309 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 IMMP2LQ96T52 175 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 DDA1Q9BW61 102 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR51I2Q9H344 312 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 VSIRQ9H7M9 311 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 PSENENQ9NZ42 101 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SPAG17Q6Q759 2223 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GV90 55 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 A8MWP6 167 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 F6UZH7 168 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 RAB29O14966 203 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 ZNF737O75373 536 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SYNGR4O95473 234 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GYPAP02724 150 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 RD3LP0DJH9 198 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 ESDP10768 282 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GZMHP20718 246 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 IL3RAP26951 378 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 ARR3P36575 388 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 PSMB3P49720 205 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CEBPGP53567 150 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CLDN18P56856 261 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 PPP1CBP62140 327 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 PAX5Q02548 391 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SLC10A1Q14973 349 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 ADIRFQ15847 76 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SSX2Q16385 188 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GABRA6Q16445 453 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 IQCJQ1A5X6 159 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TCEAL6Q6IPX3 200 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 DRAM1Q8N682 238 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 WDR31Q8NA23 367 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 NEK7Q8TDX7 302 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 LHX4Q969G2 390 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 C5orf30Q96GV9 206 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR5B12Q96R08 314 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.19□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms