RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 ADMP35318 185 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 INPP1P49441 399 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 LGI3Q8N145 548 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 LRTM2Q8N967 370 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 MISP3Q96FF7 219 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP6V0BQ99437 205 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.53□□□□□ -0.56
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SH3BP2-225ENST00000513069 TGOLN2O43493 480 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 MT-CO2P00403 227 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 IGHV3-48P01763 117 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 SRPXP78539 464 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.52□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ANXA3P12429 323 aa11.51□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 GP9P14770 177 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 VAMP1P23763 118 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 SNCAP37840 140 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 MLANAQ16655 118 aa11.51□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 PEMTQ9UBM1 199 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 SORL1Q92673 2214 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF320A2RRD8 509 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 C9orf170A2RU37 121 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 A8MWP6 167 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 PITX3O75364 302 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 NXPH3O95157 252 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 SMCO1Q147U7 214 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TM4SF20Q53R12 229 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 Q8N1Y9 231 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC32Q9BV29 185 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.5□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CENPXA8MT69 81 aa11.49□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 MFAP4P55083 255 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TNFRSF9Q07011 255 aa11.49□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 BATF3Q9NR55 127 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 COL7A1Q02388 2944 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 C8orf88P0DMB2 117 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 Q56UQ5 140 aa11.48□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 S100ZQ8WXG8 99 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 RBKSQ9H477 322 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ENY2Q9NPA8 101 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.48□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF785A8K8V0 405 aa11.47□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
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SH3BP2-225ENST00000513069 C2orf83Q53S99 150 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 MLXQ9UH92 298 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 NDUFA4O00483 81 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAP1O75689 374 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TCRBP04435 133 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 HOXB5P09067 269 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
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