RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRGNQ92686 78 aa4.53□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 CORO2AQ92828 525 aa4.53□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF714Q96N38 554 aa4.53□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 YPEL2Q96QA6 119 aa4.53□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC25A22Q9H936 323 aa4.53□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.53□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 DOK5Q9P104 306 aa4.53□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC00312Q9Y6C7 94 aa4.53□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.53□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 C15orf62A8K5M9 175 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0R1X1 148 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ITGB1BP1O14713 200 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP1R2P9O14990 202 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST1H2BKO60814 126 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC25A16P16260 332 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST1H2BOP23527 126 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST1H2BBP33778 126 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST1H2BCP62807 126 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HNF4GQ14541 408 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 OR52E5Q8NH55 327 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 C10orf105Q8TEF2 133 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.52□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 OR4F4Q96R69 305 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.52□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 F6UZH7 168 aa4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 H7BYZ3 331 aa4.51□□□□□ -1.69
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ARHGEF3-215ENST00000498517 IFNA10P01566 189 aa4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRGC1P0CF51 173 aa4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD1BP29016 333 aa4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 GALR1P47211 349 aa4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 THBS3P49746 956 aa4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB7AP51149 207 aa4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRRX1P54821 245 aa4.51□□□□□ -1.69
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP10-9P60411 292 aa4.51□□□□□ -1.69
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