RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ZNF785A8K8V0 405 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 A8MWP6 167 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 MT-CO2P00403 227 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ADMP35318 185 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 AP3S2P59780 193 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SRRQ9GZT4 340 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 CACNG5Q9UF02 275 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 MLXQ9UH92 298 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 NXPH3O95157 252 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 CTSGP08311 255 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SNCAP37840 140 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 MFAP4P55083 255 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 GUCA2BQ16661 112 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 BTNL8Q6UX41 500 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 FAM219AQ8IW50 185 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 GALNT14Q96FL9 552 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 PALMDQ9NP74 551 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ENY2Q9NPA8 101 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 CD81P60033 236 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SPCS3P61009 180 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 BAK1Q16611 211 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 AARDQ4LEZ3 155 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ATP6V0BQ99437 205 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 U3KQK5 164 aa9.05□□□□□ -0.96
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NISCH-214ENST00000490425 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 CD7P09564 240 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 C8orf88P0DMB2 117 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 CCR6P51684 374 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
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NISCH-214ENST00000490425 IL22RA2Q969J5 263 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 NEURL2Q9BR09 285 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 TUBA4BQ9H853 241 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 YIF1AO95070 293 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 ANXA3P12429 323 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 INPP1P49441 399 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 NMSQ5H8A3 153 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 LGI3Q8N145 548 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 DEFB125Q8N687 156 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 OR52E5Q8NH55 327 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 MARC2Q969Z3 335 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 TXN2Q99757 166 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
NISCH-214ENST00000490425 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 A0A0B4J2A0 478 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 A8MZ25 164 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 GNG7O60262 68 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 VAMP1P23763 118 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 OPRK1P41145 380 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 BSXQ3C1V8 233 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-214ENST00000490425 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.02□□□□□ -0.97
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