RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489789.3

CNTNAP3B-209, Transcript of contactin associated protein like 3B, human

TSL 5

Gene CNTNAP3B, Length 501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CLINT1	Q14677	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RNF5	Q99942	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CITED1	Q99966	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RBKS	Q9H477	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SLC31A2	O15432	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CST7	O76096	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM11	P17152	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MAS1L	P35410	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PAX9	P55771	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DEFA6	Q01524	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		Q6ZRG5	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		Q6ZRM9	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		H0YJW9	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SNAPIN	O95295	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM50A	O95807	157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IFNA10	P01566	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IAPP	P10997	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NPY1R	P25929	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF134	P52741	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		H3BP45	60 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CORT	O00230	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	UPK2	O00526	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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