RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 IGHV3-23P01764 117 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 MBPP02686 304 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 DEFA4P12838 97 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 MYCNOSP40205 109 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 MLANAQ16655 118 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 OR11H1Q8NG94 326 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 OR4F17Q8NGA8 305 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 OR1N2Q8NGR9 330 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 VN1R17PQ8TDU5 208 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 DTD1Q8TEA8 209 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 SCARB1Q8WTV0 552 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 OR4F4Q96R69 305 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 PDCD10Q9BUL8 212 aa10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 SYNGR2O43760 224 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 SIX6O95475 246 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 H2BFSP57053 126 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 C2orf50Q96LR7 162 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 OR4C12Q96R67 309 aa9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 PRSS46E5RG02 174 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 IAPPP10997 89 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 HTR2BP41595 481 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 SLURP1P55000 103 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 ZNF616Q08AN1 781 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 TREML4Q6UXN2 200 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 PPP5D1E7EU14 171 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 LINC01619G3V211 115 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 MT-CO2P00403 227 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 IGHV3-48P01763 117 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 ADMP35318 185 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 SNCAP37840 140 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
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GINS1-204ENST00000484893 SMIM8Q96KF7 97 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 CXorf58Q96LI9 332 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 ENY2Q9NPA8 101 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 GSKIPQ9P0R6 139 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 U3KQ87 197 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS1-204ENST00000484893 C5orf51A6NDU8 294 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 FAM25EA8MYX2 175 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 K7EPK0 472 aa9.96□□□□□ -0.82
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GINS1-204ENST00000484893 GOSR2O14653 212 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 MED6O75586 246 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 CLEC3BP05452 202 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 CTSGP08311 255 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 CXCL3P19876 107 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 NPY1RP25929 384 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 DCUN1D4Q92564 292 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 ATP6V0BQ99437 205 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 THYN1Q9P016 225 aa9.96□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 H0YIZ8 118 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 SSSCA1O60232 199 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 RAB32Q13637 225 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 NMES1Q9C002 83 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 CYB5BO43169 146 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 CCNKO75909 580 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 OR2C1O95371 312 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 IFNA10P01566 189 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 PF4P02776 101 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 OR8U8P0C7N1 319 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 GPR183P32249 361 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 TAS2R30P59541 319 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 FCN2Q15485 313 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS1-204ENST00000484893 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.94□□□□□ -0.82
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