RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.37□□□□□ -0.59
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NISCH-207ENST00000479054 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-207ENST00000479054 C14orf144Q96I85 54 aa11.34□□□□□ -0.59
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NISCH-207ENST00000479054 H0YIZ8 118 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 DLEU1O43261 78 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.61e-11■■■■□ 20.4
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NISCH-207ENST00000479054 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
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NISCH-207ENST00000479054 SRD5A1P18405 259 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 C3orf36Q3SXR2 165 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.33□□□□□ -0.6
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NISCH-207ENST00000479054 ANOS1P23352 680 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 TCTAP57738 103 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 CFPP27918 469 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 NABP2Q9BQ15 211 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 H7C1H1 209 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-207ENST00000479054 CD5P06127 495 aa11.32□□□□□ -0.6
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