RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468284.1

CKAP2-205, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene CKAP2, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-205ENST00000468284 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 CMTM3Q96MX0 182 aa6.33□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 AGMATQ9BSE5 352 aa6.33□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.33□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.33□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 V9GYH0 126 aa6.33□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TSPAN4O14817 238 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SSX5O60225 188 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 IFNA21P01568 189 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 IFNA17P01571 189 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 XGP55808 180 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TMEM187Q14656 261 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF79Q15937 498 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TNXAQ16473 311 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 CDNFQ49AH0 187 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 NECAP1Q8NC96 275 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 GALMQ96C23 342 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 ABHD1Q96SE0 405 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 RAB9BQ9NP90 201 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 DIABLOQ9NR28 239 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 AK3Q9UIJ7 227 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 HSF4Q9ULV5 492 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 AGRNO00468 2067 aa6.32□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 A0A0A6YYH2 397 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 FABP12A6NFH5 140 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 HMX3A6NHT5 357 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 A6NJ64 397 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 FGF2P09038 288 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 RPA2P15927 270 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 ETV6P41212 452 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 RANBP1P43487 201 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TM2D2Q9BX73 214 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.31□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 NACAE9PAV3 2078 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 NAPSAO96009 420 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 GLAP06280 429 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 FCER2P06734 321 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 S100A5P33763 92 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TFPI2P48307 235 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 IL18Q14116 193 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 HMGN3Q15651 99 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 FAM209BQ5JX69 171 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 HACD4Q5VWC8 232 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 OR4A47Q6IF82 309 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 PDPNQ86YL7 162 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SRRQ9GZT4 340 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.3□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 E7EUB6 86 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SCGNO76038 276 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 CLEC3BP05452 202 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 FCGR3AP08637 254 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TALDO1P37837 337 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 ARFRP1Q13795 201 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 PRSS8Q16651 343 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 C6orf223Q8N319 242 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 OR52I2Q8NH67 350 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 GPX8Q8TED1 209 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 HARBI1Q96MB7 349 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.29□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.28□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.28□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.28□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 OR4C46A6NHA9 309 aa6.28□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 C15orf61A6NNL5 157 aa6.28□□□□□ -1.4
CKAP2-205ENST00000468284 J3QRK9 145 aa6.28□□□□□ -1.4
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