RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 TSPOP30536 169 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 Q499Y3 187 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC58Q4VC31 144 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 LPAP08519 4548 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GU03 582 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 SNTNA6NMZ2 147 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 I3L2K1 104 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 SLC22A5O76082 557 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 DEFB1P60022 68 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 LGALS12Q96DT0 336 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 ABHD1Q96SE0 405 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0A6YYD4 124 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 K7EP13 123 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 MT-CO2P00403 227 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 FGF2P09038 288 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 CD37P11049 281 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 NPBWR1P48145 328 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 RASSF2P50749 326 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 MS4A2Q01362 244 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 XAF1Q6GPH4 301 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 TPRA1Q86W33 373 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 OR1P1Q8NH06 330 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 SLC29A1Q99808 456 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 NRN1Q9NPD7 142 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-211ENST00000463372 A0A096LPF7 62 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 ADAP1O75689 374 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 RORCP51449 518 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 PPP5CP53041 499 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 B2MP61769 119 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 UNC119Q13432 240 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 CDK1P06493 297 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 HOXA5P20719 270 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 EVI2AP22794 236 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 ASAH1Q13510 395 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF79Q15937 498 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM19Q96E16 107 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00052Q96N35 136 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 CENPOQ9BU64 300 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 KCNK15Q9H427 330 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM140Q9NV12 185 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 NQO2P16083 231 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 AZU1P20160 251 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 PAX9P55771 341 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TAS2R31P59538 309 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 ODF1Q14990 250 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 FAM78BQ5VT40 261 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 LRTM2Q8N967 370 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM230Q96A57 120 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM56Q96MV1 263 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 PECRQ9BY49 303 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 INSP01308 110 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV2-14P01704 120 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 FCGR3AP08637 254 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 CD300CQ08708 224 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 ST3GAL4Q11206 333 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 MARCH11A6NNE9 402 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM50AO95807 157 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 BPNT1O95861 308 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV2-11P01706 119 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM50BP56557 158 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms