RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430918.5

HDLBP-217, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene HDLBP, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-217ENST00000430918 S100GP29377 79 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 PRCDQ00LT1 54 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 LEMD1Q68G75 181 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 TCF24Q7RTU0 167 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 OR11H2Q8NH07 326 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 ST8SIA2Q92186 375 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 TXN2Q99757 166 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 ST8SIA3O43173 380 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 DEFB131AP59861 70 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 PAFAH1B2P68402 229 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 LILRB2Q8N423 598 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF114Q8NC26 417 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 GPX8Q8TED1 209 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 GINS3Q9BRX5 216 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 DFFBO76075 338 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 IFNA4P05014 189 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 YIPF6Q96EC8 236 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 MFFQ9GZY8 342 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-217ENST00000430918 A0A1B0GU03 582 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 M0QYG6 137 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PI3P19957 117 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 RCVRNP35243 200 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PRR20EP86478 221 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PRR20CP86479 221 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PRR20DP86480 221 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PRR20BP86481 221 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PRR20AP86496 221 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 TMEM187Q14656 261 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 SLC35G3Q8N808 338 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 VSIRQ9H7M9 311 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 RABAC1Q9UI14 185 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 HPGDSO60760 199 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 TMEM50AO95807 157 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 IFNA17P01571 189 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 IGKV1-5P01602 117 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PGAM2P15259 253 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 SNCAP37840 140 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 NPBWR1P48145 328 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 AKR1C2P52895 323 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 UCP3P55916 312 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 NCS1P62166 190 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 STHQ8IWL8 128 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 TP53RKQ96S44 253 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 IGLL5B9A064 214 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 APOA1P02647 267 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 CD5P06127 495 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 ELK1P19419 428 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 ETV6P41212 452 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PPP5CP53041 499 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PIGPP57054 158 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 VBP1P61758 197 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 MLANAQ16655 118 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 A0A0B4J293 547 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 KNCNA6PVL3 124 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 P0C879 139 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 NPPCP23582 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 OPRK1P41145 380 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 RND3P61587 244 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 SP6Q3SY56 376 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 Q8NAQ8 132 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-217ENST00000430918 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.43□□□□□ -1.22
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