RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ODC1-202ENST00000405333 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
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ODC1-202ENST00000405333 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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ODC1-202ENST00000405333 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.131e-11■■■□□ 18.1
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ODC1-202ENST00000405333 SOX15O60248 233 aa15.8■□□□□ 0.12
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ODC1-202ENST00000405333 RAB14P61106 215 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 ACSM6Q6P461 480 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 TEPPQ6URK8 271 aa15.8■□□□□ 0.12
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ODC1-202ENST00000405333 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 K7EIM0 57 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 RND2P52198 227 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 TEX29Q8N6K0 151 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-202ENST00000405333 AGPAT2O15120 278 aa15.79■□□□□ 0.12
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