RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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ZNF548-201ENST00000336128 STAG3L3P0CL85 134 aa9.92□□□□□ -0.82
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ZNF548-201ENST00000336128 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.91□□□□□ -0.82
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ZNF548-201ENST00000336128 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.89□□□□□ -0.83
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ZNF548-201ENST00000336128 TVP23CQ96ET8 276 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-201ENST00000336128 OR4F4Q96R69 305 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-201ENST00000336128 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-201ENST00000336128 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-201ENST00000336128 MT-CO2P00403 227 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-201ENST00000336128 OR5G3P0C626 314 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-201ENST00000336128 FAM106CPP0CH98 169 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2G2P60604 165 aa9.88□□□□□ -0.83
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