RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR13Q9NZ81 148 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 MT-CO2P00403 227 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q56UQ5 140 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPSB3Q6PJ21 355 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLXQ9UH92 298 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF785A8K8V0 405 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL22RA2Q969J5 263 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR146Q96CH1 333 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 PALMDQ9NP74 551 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNG5Q9UF02 275 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 UFC1Q9Y3C8 167 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 A8MZ25 164 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSGP08311 255 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf88P0DMB2 117 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKR1C4P17516 323 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 U3KQK5 164 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFA4O00483 81 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-48P01763 117 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNCAP37840 140 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFAP4P55083 255 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPCS3P61009 180 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTNL8Q6UX41 500 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52E5Q8NH55 327 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARC2Q969Z3 335 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 TENM3Q9P273 2699 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD81P60033 236 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 BSXQ3C1V8 233 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXN2Q99757 166 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENY2Q9NPA8 101 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAK1Q16611 211 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUCA2BQ16661 112 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMSQ5H8A3 153 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0B4J2A0 478 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD7P09564 240 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANXA3P12429 323 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRPXP78539 464 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEURL2Q9BR09 285 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CORTO00230 105 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXPH3O95157 252 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIQKQ629K1 86 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGI3Q8N145 548 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNG7O60262 68 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 C15orf62A8K5M9 175 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7EMT4 169 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR2BP41595 481 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR6P51684 374 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 VAMP1P23763 118 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms