RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 WNT10AQ9GZT5 417 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ARV1Q9H2C2 271 aa15.52■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 FNDC10F2Z333 226 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 DEFA4P12838 97 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 MFAP2P55001 183 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 C19orf35Q6ZS72 473 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.51■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 IGF1P05019 195 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CD69Q07108 199 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ECSCRQ19T08 205 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 PHYHIPLQ96FC7 376 aa15.5■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CYB5BO43169 146 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 TSPAN9O75954 239 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 GINS3Q9BRX5 216 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 IFNA7P01567 189 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 OPRK1P41145 380 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 C19orf54Q5BKX5 351 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 MISP3Q96FF7 219 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF580Q9UK33 172 aa15.49■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 TRAV41A0A0B4J266 112 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 AP4M1O00189 453 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 RGS13O14921 159 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ETFRF1Q6IPR1 90 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 SLC16A13Q7RTY0 426 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 OR5T1Q8NG75 326 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 PRSS22Q9GZN4 317 aa15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 SMCO3A2RU48 225 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 G3V318 75 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CLDN34H7C241 214 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 Q6ZS46 218 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF767PQ75MW2 155 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 DUX5Q96PT3 197 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 KLK9Q2XQG4 91 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ALKAL2Q6UX46 152 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 TREML4Q6UXN2 200 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 Q71RC1 249 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 SLC35E1Q96K37 410 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 FANCD2OSQ96PS1 177 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 KLK9Q9UKQ9 250 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 INAFM1C9JVW0 142 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM77I1YAP6 450 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 AKR1C1Q04828 323 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 GAMTQ14353 236 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC71-201ENST00000321895 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 MPDU1O75352 247 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 PRH1P02810 166 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SEC11BP0C7V7 166 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SPP1P10451 314 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 FGF7P21781 194 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ATP6V0CP27449 155 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 MLANAQ16655 118 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SCARB1Q8WTV0 552 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 TMED6Q8WW62 240 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ESM1Q9NQ30 184 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 THYN1Q9P016 225 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 I3L2K1 104 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 MT-CO2P00403 227 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 RUNX1Q01196 453 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 BTNL8Q6UX41 500 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM144Q7Z5S9 345 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF702PQ9H963 129 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 LINC00527Q9UJ94 153 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 F8P00451 2351 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 TEPPQ6URK8 271 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SH3BGRL3Q9H299 93 aa15.44■□□□□ 0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms