RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 IAPPP10997 89 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 DEFA4P12838 97 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ID3Q02535 119 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CFHR3Q02985 330 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 FOXL1Q12952 345 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 NMES1Q9C002 83 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GUS0 222 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM89A2RUT3 159 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 K7EPK0 472 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SOX15O60248 233 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO24O75426 580 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV1-40P01703 118 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CRYGCP07315 174 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PF4V1P10720 104 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CTRB1P17538 263 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SNCAP37840 140 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PROK1P58294 105 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 DEFA5Q01523 94 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 IL15RAQ13261 267 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 RAB32Q13637 225 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TEX38Q6PEX7 206 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR2C3Q8N628 320 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MS4A10Q96PG2 267 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 H3BP45 60 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 L7N2F9 121 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CYB5BO43169 146 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 IFNA10P01566 189 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 IGHG4P01861 327 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HTR2BP41595 481 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 RIPPLY3P57055 190 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TPPP2P59282 170 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 VAMP2P63027 116 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CD83Q01151 205 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 FOXE3Q13461 319 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 AWAT1Q58HT5 328 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM65Q6PI78 240 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF114Q8NC26 417 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 P2RX4Q99571 388 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP57Q9NU63 452 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PSENENQ9NZ42 101 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 H3BUA1 57 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 DEDDO75618 318 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OR2J3O76001 311 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM50AO95807 157 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TRGV3P03979 118 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RLN2P04090 185 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PET100P0DJ07 73 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CD28P10747 220 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 NPY1RP25929 384 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PSMB8P28062 276 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RAB9AP51151 201 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 BCAP31P51572 246 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MFAP2P55001 183 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RAP2BP61225 183 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 BSXQ3C1V8 233 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 COMMD1Q8N668 190 aa6.64□□□□□ -1.35
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