RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610356.4

RDH13-223, Transcript of retinol dehydrogenase 13, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDH13, Length 1,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDH13-223	ENST00000610356	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356		Q8WTZ3	238 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356		A0A1W2PN81	502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	SOX15	O60248	233 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	IFNA1	P01562	189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	PRTN3	P24158	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CHRNA7	P36544	502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	RND2	P52198	227 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	RITA1	Q96K30	269 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	LRBA	P50851	2863 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ZFP92	A6NM28	416 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CXCL1	P09341	107 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	HOXA5	P20719	270 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	HTR1D	P28221	377 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	FNDC10	F2Z333	226 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CEACAM3	P40198	252 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356		A0A1W2PPI3	338 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	RNF224	P0DH78	156 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	TGOLN2	O43493	480 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CLN5	O75503	358 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	OPRK1	P41145	380 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	KLRD1	Q13241	179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CCL19	Q99731	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	MGST2	Q99735	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CLDN34	H7C241	214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CYB5B	O43169	146 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	PDLIM4	P50479	330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	PSG5	Q15238	335 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356		E7EUB6	86 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	PRSS8	Q16651	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	RNF5	Q99942	180 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RDH13-223	ENST00000610356	TNC	P24821	2201 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	TIMM23	O14925	209 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	ACTL6B	O94805	426 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	CRYGB	P07316	175 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	CNTFR	P26992	372 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	LCN2	P80188	198 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	RAB31	Q13636	194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RDH13-223	ENST00000610356	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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