RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554196.1

LINC00520-202, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00520, Length 514 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-202ENST00000554196 NPFFO15130 113 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 TSPAN15O95858 294 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 IGKV1D-33P01593 117 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 IGKV1-33P01594 117 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 RAB31Q13636 194 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 PLGLAQ15195 96 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 MMDQ15546 238 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 TNXAQ16473 311 aa7.37□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 SLC35E1Q96K37 410 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 RSG1Q9BU20 258 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.37□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 GHRHP01286 108 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 IGHV1-69P01742 117 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 FAM106CPP0CH98 169 aa7.36□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 OPRK1P41145 380 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 AKR1C1Q04828 323 aa7.36□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 SSX2Q16385 188 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.36□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 Q8N6K4 173 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.36□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 HRH4Q9H3N8 390 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 A0A1B0GW64 132 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 OR13C7P0DN81 318 aa7.35□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 TREML4Q6UXN2 200 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.35□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.34□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 A0A1W2PRM7 423 aa7.34□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 OPN1MWP04001 364 aa7.34□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 M6PRP20645 277 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 CNTFRP26992 372 aa7.34□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 BPIFB3P59826 476 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 WT1-ASQ06250 92 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 Q5PR19 223 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 OR1P1Q8NH06 330 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 NRGNQ92686 78 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 CCDC140Q96MF4 163 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-202ENST00000554196 TEX22C9J3V5 150 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-202ENST00000554196 CNIH1O95406 144 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-202ENST00000554196 HLA-DRB1P01911 266 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-202ENST00000554196 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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