RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553920.5

RBM23-211, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-211	ENST00000553920	LCE6A	A0A183	80 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SOX15	O60248	233 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	TOMM40	O96008	361 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	HBZ	P02008	142 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	MGMT	P16455	207 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	RAB9A	P51151	201 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	INSL3	P51460	131 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SLURP1	P55000	103 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PITPNA	Q00169	270 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	NDP	Q00604	133 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PLA2G7	Q13093	441 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	GNMT	Q14749	295 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	MPV17L	Q2QL34	196 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	GAPT	Q8N292	157 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	APH1B	Q8WW43	257 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM106A	Q96A25	262 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SFRP2	Q96HF1	295 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	VSIG4	Q9Y279	399 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OVOL1	O14753	267 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	LANCL1	O43813	399 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	HLA-DRB1	P01911	266 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	GP9	P14770	177 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	IL3RA	P26951	378 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	RAB40B	Q12829	278 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OR5I1	Q13606	314 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	RHEB	Q15382	184 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	MMD	Q15546	238 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	MORN2	Q502X0	79 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	KCTD9	Q7L273	389 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	LINC00596	Q86U02	117 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF429	Q86V71	674 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920		Q8N1Y9	231 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920		Q8N402	240 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	NECAP1	Q8NC96	275 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OR4S2	Q8NH73	311 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	GPR148	Q8TDV2	347 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	NABP2	Q9BQ15	211 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	HRH4	Q9H3N8	390 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PARP11	Q9NR21	331 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	GNG12	Q9UBI6	72 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920		A0A087WW49	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	HELT	A6NFD8	242 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OR11H12	B2RN74	326 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PPP5D1	E7EU14	171 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PHOX2A	O14813	284 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SAP30	O75446	220 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	CA11	O75493	328 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PMP2	P02689	132 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OR5H8	P0DN80	308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	LYL1	P12980	280 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	UCP1	P25874	307 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	COX19	Q49B96	90 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	ACSM6	Q6P461	480 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	LYPD6	Q86Y78	171 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-211	ENST00000553920	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41

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