RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 GPX8Q8TED1 209 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TRDCB7Z8K6 153 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 MMP23AO75900 390 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ZNF146Q15072 292 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SP6Q3SY56 376 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 GFI1Q99684 422 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 HCFC1P51610 2035 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 H7BYZ3 331 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 OR9G1Q8NH87 305 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 Q8TCH9 128 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TNFRSF14Q92956 283 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 DPM3Q9P2X0 92 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 A0A1W2PRX2 142 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CD1AP06126 327 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TAS2R31P59538 309 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RANP62826 216 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 COQ2Q96H96 371 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RNF126Q9BV68 326 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 GNG7O60262 68 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CATR1Q13166 79 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 OR4A47Q6IF82 309 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 DEFA4P12838 97 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 FBLN7Q53RD9 439 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 BET1LQ9NYM9 111 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RNF212BA8MTL3 300 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ADH4P08319 380 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ECSCRQ19T08 205 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ZNF695Q8IW36 515 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 C2orf50Q96LR7 162 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ENY2Q9NPA8 101 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 A0A0A6YYD4 124 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 NPFFO15130 113 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1D-33P01593 117 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1-33P01594 117 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CTXN2P0C2S0 81 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 LINC00205P59089 165 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 UBE2G2P60604 165 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SELENOTP62341 195 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 UBE2V1Q13404 147 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RTL8BQ17RB0 113 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 BAGE3Q86Y29 109 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 BAGE2Q86Y30 109 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 TEX29Q8N6K0 151 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SMIM12Q96EX1 92 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 IGLV3-1P01715 115 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 AADACP22760 399 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CFHR2P36980 270 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 LINC00596Q86U02 117 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 DRAM1Q8N682 238 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms