RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524884.1

BBS1-206, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 4

Gene BBS1, Length 572 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-206	ENST00000524884	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS1-206	ENST00000524884	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RELN	P78509	3460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	MLNR	O43193	412 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	HAND1	O96004	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	MT-CO2	P00403	227 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	BCL2	P10415	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	CD99	P14209	185 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RAB5A	P20339	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	GZMH	P20718	246 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	S100P	P25815	95 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	CFHR2	P36980	270 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	PSMB3	P49720	205 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	FHIT	P49789	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	COTL1	Q14019	142 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	MDP1	Q86V88	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RAB1C	Q92928	201 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884		A0A1W2PPI3	338 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884		A0A1W2PPV4	95 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	PINLYP	A6NC86	204 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	ARGFX	A6NJG6	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	CLDN34	H7C241	214 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RAB29	O14966	203 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	PDE6D	O43924	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	OR2H2	O95918	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	NGF	P01138	241 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	S100A2	P29034	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	MEOX2	P50222	304 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	DYNLT3	P51808	116 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	AKR1D1	P51857	326 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	OR2B8P	P59922	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	UBE2K	P61086	200 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF154	Q13106	437 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	RAB31	Q13636	194 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS1-206	ENST00000524884	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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