RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 LGALS7P47929 136 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 HSPA13P48723 471 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP10-5P60370 271 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ARL6IP1Q15041 203 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PLGLAQ15195 96 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PSG5Q15238 335 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 P2RY14Q15391 338 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RAB11BQ15907 218 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PRSS48Q7RTY5 328 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR4A4PQ8NGN8 299 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 MGLLQ99685 303 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 VCX3BQ9H321 246 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 GNB4Q9HAV0 340 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 UBQLN2Q9UHD9 624 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 AK3Q9UIJ7 227 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF221Q9UK13 617 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RAB22AQ9UL26 194 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 U3KQK5 164 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 A0A0A6YYD4 124 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 A0A0G2JLM5 398 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TRDCB7Z8K6 153 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 LINC01619G3V211 115 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PDCD5O14737 125 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 APOA2P02652 100 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SCTP09683 121 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 HSMCR30P0CW71 290 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RRASP10301 218 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CRHBPP24387 322 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 GADD45AP24522 165 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 AQP4P55087 323 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SRPXP78539 464 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 NDPQ00604 133 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CD300CQ08708 224 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ACTBL2Q562R1 376 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZS49 121 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PPP1R27Q86WC6 154 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DCUN1D4Q92564 292 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM203Q969S6 136 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FAM3DQ96BQ1 224 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ABHD14BQ96IU4 210 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CYYR1Q96J86 154 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PECRQ9BY49 303 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FBXL15Q9H469 300 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 V9GY05 133 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 IFITM5A6NNB3 132 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 C3orf84H3BNL1 204 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FCN1O00602 326 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FABP7O15540 132 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV1-16P04430 117 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FCGR3AP08637 254 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CD3GP09693 182 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR8U9P0C7N5 309 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZP3P21754 424 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RPS25P62851 125 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FABP5Q01469 135 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CBX3Q13185 183 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SSX1Q16384 188 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ECSCRQ19T08 205 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 LFNGQ8NES3 379 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR10J5Q8NHC4 309 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ARPC1AQ92747 370 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RAB3CQ96E17 227 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR4C12Q96R67 309 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC90BQ9GZT6 254 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RDH8Q9NYR8 311 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 M0R1X1 148 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 MFNGO00587 321 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms