RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-215	ENST00000514625	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625		A0A0B4J293	547 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	IFNA17	P01571	189 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	IL7	P13232	177 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	INSL3	P51460	131 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SRPX	P78539	464 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM187	Q14656	261 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	S100Z	Q8WXG8	99 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	WIPF1	O43516	503 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SAP30	O75446	220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CCR6	P51684	374 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	LGI3	Q8N145	548 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	VAMP1	P23763	118 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SNCA	P37840	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625		S4R3C0	116 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625		A0A0B4J2A0	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	BMPR1B	O00238	502 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	NDUFB6	O95139	128 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	ARL3	P36405	182 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SPINK9	Q5DT21	86 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625		Q6ZRM9	215 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	PRR13	Q9NZ81	148 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	SPCS3	P61009	180 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	CLEC3B	P05452	202 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	MFAP2	P55001	183 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-215	ENST00000514625	LYRM1	O43325	122 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	OR2C1	O95371	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	SFT2D2	O95562	160 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	PPP1R1A	Q13522	171 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	GPR183	P32249	361 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-215	ENST00000514625	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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