RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	COA4	Q9NYJ1	87 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TNC	P24821	2201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	LGALS9	O00182	355 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC22A5	O76082	557 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	FCGR3A	P08637	254 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	CD3G	P09693	182 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	GADD45A	P24522	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	HERV-K104	P61576	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RCN1	Q15293	331 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	KLK9	Q2XQG4	91 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5T1	Q8NG75	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB3C	Q96E17	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PHB2	Q99623	299 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	SCN3B	Q9NY72	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB22A	Q9UL26	194 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	KMT2A	Q03164	3969 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552		A8MWP6	167 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	MFNG	O00587	321 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	BET1	O15155	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM18	P0DKX4	95 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	CD36	P16671	472 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DTYMK	P23919	212 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	MAS1L	P35410	378 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RHOG	P84095	191 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	CDK10	Q15131	360 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	VWC2	Q2TAL6	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	GINS4	Q9BRT9	223 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DUSP21	Q9H596	190 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552		V9GY05	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	MSGN1	A6NI15	193 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2C	O00762	179 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PDCD5	O14737	125 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	SCGN	O76038	276 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	CRYZL1	O95825	349 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DHFR	P00374	187 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TRBV12-3	P01733	135 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	CTXN2	P0C2S0	81 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	GSTT2	P0CG29	244 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	GSTT2B	P0CG30	244 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	GAL	P22466	123 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP5G2	Q06055	141 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	MSMO1	Q15800	293 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TNXA	Q16473	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	GPHB5	Q86YW7	130 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	C2orf70	A6NJV1	201 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	IFITM5	A6NNB3	132 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DFFB	O76075	338 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	KBTBD11	O94819	623 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE4D-222	ENST00000514552	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6

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