RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 ITGB1BP1O14713 200 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 SIGLEC5O15389 551 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 NDUFB3O43676 98 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 NDUFA2O43678 99 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 YPEL1O60688 119 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 PITX3O75364 302 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 CLDN1O95832 211 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 TSHBP01222 138 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 IGKV1-39P01597 117 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 IGKV1D-39P04432 117 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 NMBP08949 121 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 THBS3P49746 956 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 RAB7AP51149 207 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 Q3ZCU0 254 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 YPEL2Q96QA6 119 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM106BQ9NUM4 274 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 MMP24Q9Y5R2 645 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 LINC00312Q9Y6C7 94 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 TACC2O95359 2948 aa2.29□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 USP24Q9UPU5 2620 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 H3BP45 60 aa2.28□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 RAB29O14966 203 aa2.28□□□□□ -2.04
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SMYD3-215ENST00000490322 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.28□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 FGF16O43320 207 aa2.28□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 SYNGR2O43760 224 aa2.28□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 CHST1O43916 411 aa2.28□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 RAMP3O60896 148 aa2.28□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 MED6O75586 246 aa2.28□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 S1PR2O95136 353 aa2.28□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 HPRT1P00492 218 aa2.28□□□□□ -2.04
SMYD3-215ENST00000490322 KRASP01116 189 aa2.28□□□□□ -2.04
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