RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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PRPF40A-210ENST00000489741 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PRPF40A-210ENST00000489741 TAS2R8Q9NYW2 309 aa4.69□□□□□ -1.66
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PRPF40A-210ENST00000489741 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF40A-210ENST00000489741 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0J9YWU9 116 aa4.68□□□□□ -1.66
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PRPF40A-210ENST00000489741 UBE2CO00762 179 aa4.68□□□□□ -1.66
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