RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880		Q56UQ5	140 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1-5	P01602	117 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	OR5AC1	P0C628	307 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	FOLR2	P14207	255 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	EDN2	P20800	178 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	GUCA2B	Q16661	112 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N402	240 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	NAA60	Q9H7X0	242 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ENY2	Q9NPA8	101 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SNCA	P37840	140 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TGOLN2	O43493	480 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	AKR1C4	P17516	323 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	UCP1	P25874	307 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	INPP1	P49441	399 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	MFAP2	P55001	183 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	GPHB5	Q86YW7	130 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	CADM3	Q8N126	398 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	PALMD	Q9NP74	551 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS9	O00182	355 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	NXPH3	O95157	252 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	CBLN1	P23435	193 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ETV6	P41212	452 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	AP3S2	P59780	193 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TM4SF20	Q53R12	229 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	OR1P1	Q8NH06	330 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	GPR132	Q9UNW8	380 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0B4J293	547 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	CD81	P60033	236 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	DHODH	Q02127	395 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880		U3KQK5	164 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880		K7EIM0	57 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	YIF1A	O95070	293 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	MT-CO2	P00403	227 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	MFAP4	P55083	255 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	KLK9	Q2XQG4	91 aa		11.21	□□□□□ -0.61

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