RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 ANKRD7Q92527 254 aa-1.26□□□□□ -2.61
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SHQ1-204ENST00000468347 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
SHQ1-204ENST00000468347 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-1.26□□□□□ -2.61
SHQ1-204ENST00000468347 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
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SHQ1-204ENST00000468347 OR51H1Q8NH63 302 aa-1.27□□□□□ -2.61
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SHQ1-204ENST00000468347 OR8D4Q8NGM9 314 aa-1.28□□□□□ -2.61
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SHQ1-204ENST00000468347 LYRM4Q9HD34 91 aa-1.28□□□□□ -2.61
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SHQ1-204ENST00000468347 NMRK1Q9NWW6 199 aa-1.28□□□□□ -2.61
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