RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902		P0C879	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	VAMP1	P23763	118 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	TMEM187	Q14656	261 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	SORL1	Q92673	2214 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	FAM209B	Q5JX69	171 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	BMPR1B	O00238	502 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ARL3	P36405	182 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	INSL3	P51460	131 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	SRPX	P78539	464 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZRM9	215 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	LGI3	Q8N145	548 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	S100Z	Q8WXG8	99 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	CLEC3B	P05452	202 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	SNCA	P37840	140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	MFAP2	P55001	183 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	KLK9	Q2XQG4	91 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB6	O95139	128 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	NXPH3	O95157	252 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	OR2C1	O95371	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	GPR183	P32249	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902		A0A0B4J2A0	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	LY86	O95711	162 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R1A	Q13522	171 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SFT2D2	O95562	160 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SPCS3	P61009	180 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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