RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	SMIM19	Q96E16	107 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	C17orf77	Q96MU5	243 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	XCL2	Q9UBD3	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	FAT1	Q14517	4588 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	OGG1	O15527	345 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CYB5B	O43169	146 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	LALBA	P00709	142 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	UBB	P0CG47	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	HLA-G	P17693	338 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	AQP4	P55087	323 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	OR2B8P	P59922	312 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	UNC119	Q13432	240 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	IRF3	Q14653	427 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504		Q6ZSN1	163 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	KCTD9	Q7L273	389 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	LILRB2	Q8N423	598 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	ST8SIA2	Q92186	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC29A1	Q99808	456 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	GINS4	Q9BRT9	223 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	TM2D1	Q9BX74	207 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	NACA	E9PAV3	2078 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	NUDT3	O95989	172 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF688	P0C7X2	276 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	GNB3	P16520	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CBX5	P45973	191 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	ETV1	P50549	477 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	HAMP	P81172	84 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	AKAP14	Q86UN6	197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	DKK2	Q9UBU2	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CD5	P06127	495 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CTSG	P08311	255 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	OR13C7	P0DN81	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CEL	P19835	753 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CCL18	P55774	89 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM50B	P56557	158 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4S2	Q8NH73	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504		Q96MT0	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	DERL3	Q96Q80	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	PECR	Q9BY49	303 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	MBD2	Q9UBB5	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	SPATA2	Q9UM82	520 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	POMP	Q9Y244	141 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HDLBP-222	ENST00000449504	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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