RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CANT1Q8WVQ1 401 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACOT12Q8WYK0 555 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR52E6Q96RD3 313 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PKHD1P08F94 4074 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAGE12JA6NER3 117 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRASO14807 208 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV1-69P01742 117 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1QBP02746 253 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSD17B1P14061 328 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATF1P18846 271 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMB9P28065 219 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERVFC1-1P60608 527 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC35A2P78381 396 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RUNX1Q01196 453 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR8G1Q15617 311 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2T5Q6IEZ7 315 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF613Q6PF04 617 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM24BQ8N5W8 94 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR5D16Q8NGK9 328 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2T29Q8NH02 315 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFSD8Q8NHS3 518 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF563Q8TA94 476 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR7D2Q96RA2 312 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RARRES2Q99969 163 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A0U1RQV1 116 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YIF1AO95070 293 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC2A10O95528 541 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV2-14P01704 120 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-13P01766 116 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PGA4P0DJD7 388 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PGA3P0DJD8 388 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PGA5P0DJD9 388 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCALDP61601 193 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NANOGP8Q6NSW7 305 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR51A2Q8NGJ7 313 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF519Q8TB69 540 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPRL2Q8WTW4 380 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNBD2Q96M20 576 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MROQ9BYG7 248 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NANOGQ9H9S0 305 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRNDQ9UKY0 176 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM189A5PLL7 270 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC01548A6NM66 108 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F6UB75 175 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COPEO14579 308 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANGPTL7O43827 346 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAGE7O76087 117 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MOSP00540 346 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOA2P02652 100 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DBIP07108 87 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD55P08174 381 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBBP0CG47 229 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAGE12FP0CL80 117 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAGE12GP0CL81 117 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAGE12IP0CL82 117 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK2P24941 298 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PFN2P35080 140 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPM6AP51674 278 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SELENOWP63302 87 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAGE4Q13068 117 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF141Q15928 474 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LY6EQ16553 131 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LTC4SQ16873 150 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDNFQ49AH0 187 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM201AQ5SY85 155 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms