RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 C20orf24Q9BUV8 137 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 RYR2Q92736 4967 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 C15orf61A6NNL5 157 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 RORCP51449 518 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 UCP3P55916 312 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 VBP1P61758 197 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 NCS1P62166 190 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 MZT2AQ6P582 158 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 OR1P1Q8NH06 330 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 K7EMT4 169 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 TSPAN4O14817 238 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 MFAP2P55001 183 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 APOC4P55056 127 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 AP3S1Q92572 193 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 OR4C46A6NHA9 309 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 C15orf62A8K5M9 175 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 FAM25AB3EWG3 89 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 FAM25CB3EWG5 89 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 FAM25GB3EWG6 89 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 K7EIM0 57 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ELK1P19419 428 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 SEC22AQ96IW7 307 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 TXN2Q99757 166 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 HPGDSO60760 199 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ATG12O94817 140 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 PGAM2P15259 253 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ADMP35318 185 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 MFAP4P55083 255 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 MISP3Q96FF7 219 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 DBX1A6NMT0 343 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 UBE2CO00762 179 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 YIF1AO95070 293 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 CTSGP08311 255 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 PRCDQ00LT1 54 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ZNF114Q8NC26 417 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 F8W735 103 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 M0QYG6 137 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 GNG7O60262 68 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 TBPP20226 339 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 BMI1P35226 326 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 SNCAP37840 140 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 RND3P61587 244 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 Q6ZWC4 215 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 STPG3Q8N7X2 389 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 SMPXQ9UHP9 88 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 CSMD3Q7Z407 3707 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 I3L2K1 104 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 MT-CO2P00403 227 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 IGKV1-39P01597 117 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 IGKV1D-39P04432 117 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 AKR1C2P52895 323 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 KIR2DL5AQ8N109 375 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 GINS3Q9BRX5 216 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 KLK11Q9UBX7 282 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-206ENST00000431413 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SPRY2O43597 315 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CD5P06127 495 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 NPBWR1P48145 328 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 PIGPP57054 158 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SLC35G3Q8N808 338 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 DUSP18Q8NEJ0 188 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 GALNT14Q96FL9 552 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms