RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431099.3

CBWD1-208, Transcript of COBW domain containing 1, human

TSL 5

Gene CBWD1, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD1-208	ENST00000431099	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	APOA1	P02647	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	CSN3	P07498	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	CTRB1	P17538	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	HLA-G	P17693	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	S100G	P29377	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	HERV-K104	P61576	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	NEDD8	Q15843	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	RYR3	Q15413	4870 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099		A0A0A0MQY5	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	BMPR1B	O00238	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SULT1C2	O00338	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	NDUFB8	O95169	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	IFNA6	P05013	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	DEFA4	P12838	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	MYOD1	P15172	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	F2R	P25116	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	PRSS3	P35030	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR2B8P	P59922	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	ERVK-16	P61578	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF45	Q02386	682 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	MXD1	Q05195	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	GPR31	O00270	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	UPK2	O00526	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	RPA2	P15927	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TBP	P20226	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	GNRHR	P30968	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	AP3S1	Q92572	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SNAPC5	O75971	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	OR2J3	O76001	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	CD5	P06127	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	SERPINE2	P07093	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD1-208	ENST00000431099	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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