RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 HARBI1Q96MB7 349 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RNF5Q99942 180 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RARRES2Q99969 163 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 MANBALQ9NQG1 85 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 VAX2Q9UIW0 290 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 FAM74A7A6NL05 159 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 B4DEV8 164 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RRHO14718 337 aa8.12□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 IGLV1-47P01700 117 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1-16P04430 117 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 LIPFP07098 398 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 PSMB3P49720 205 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.111e-6■■□□□ 12.6
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POLR1A-204ENST00000424089 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF726P1Q15940 193 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 HAGHQ16775 308 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 BSXQ3C1V8 233 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SPINK9Q5DT21 86 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 LCN15Q6UWW0 184 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TREML4Q6UXN2 200 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TEX45Q8NA69 505 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 VSIRQ9H7M9 311 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CHODLQ9H9P2 273 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 GNG13Q9P2W3 67 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.11□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 M0R036 132 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 M0R1W7 72 aa8.11□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 MAS1LP35410 378 aa8.11□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 TEPPQ6URK8 271 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.11□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 PRELID1Q9Y255 219 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 ROS1P08922 2347 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PPV4 95 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM250H0YL14 139 aa8.1□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RAB24Q969Q5 203 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TVP23CQ96ET8 276 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CUBNO60494 3623 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CXorf65A6NEN9 183 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 ZFP92A6NM28 416 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 H3BQ15 152 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1D-33P01593 117 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1-33P01594 117 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV2-23P01705 113 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 MT-ND4LP03901 98 aa8.09□□□□□ -1.11
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