RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 MED9Q9NWA0 146 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 TMEM249Q2WGJ8 235 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 A0A0U1RQK1 487 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 IGLC7A0M8Q6 106 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 UMAD1C9J7I0 102 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 J3QLI3 93 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 AVPP01185 164 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 REG1AP05451 166 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.352e-7■□□□□ 11.2
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LMO2-202ENST00000395833 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 APELAP0DMC3 54 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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LMO2-202ENST00000395833 C1RLQ9NZP8 487 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 FAM96BQ9Y3D0 163 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO2-202ENST00000395833 FAM213BQ8TBF2 198 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 ABHD5Q8WTS1 349 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 P2RX4Q99571 388 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 PARP11Q9NR21 331 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 TIMM9Q9Y5J7 89 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.347e-7■■■□□ 16.5
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LMO2-202ENST00000395833 AREGP15514 252 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 ZNF616Q08AN1 781 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 ZNF709Q8N972 641 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 WDR83OSQ9Y284 106 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 PLXNB1O43157 2135 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 TEX22C9J3V5 150 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 FHITP49789 147 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 SSMEM1Q8WWF3 244 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 HRH4Q9H3N8 390 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 AKR1C1Q04828 323 aa23.43■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 FXYD3Q14802 87 aa23.43■■□□□ 1.34
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LMO2-202ENST00000395833 MDKP21741 143 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 NPCDR1Q9BY65 106 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 C17orf112F2Z3M2 114 aa23.41■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 S100A1P23297 94 aa23.41■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 TREML4Q6UXN2 200 aa23.41■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 MEGF9Q9H1U4 602 aa23.41■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 NPVFQ9HCQ7 196 aa23.41■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 ELLP55199 621 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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LMO2-202ENST00000395833 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 MFSD2BA6NFX1 497 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 Q8N9W7 124 aa23.4■■□□□ 1.34
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LMO2-202ENST00000395833 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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LMO2-202ENST00000395833 FNDC10F2Z333 226 aa23.39■■□□□ 1.34
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LMO2-202ENST00000395833 RASL11BQ9BPW5 248 aa23.39■■□□□ 1.34
LMO2-202ENST00000395833 CX3CL1P78423 397 aa23.38■■□□□ 1.33
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LMO2-202ENST00000395833 CYB5R2Q6BCY4 276 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 ZNF562Q6V9R5 426 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 SLC16A13Q7RTY0 426 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 ARPC1AQ92747 370 aa23.38■■□□□ 1.33
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LMO2-202ENST00000395833 C19orf35Q6ZS72 473 aa23.38■■□□□ 1.33
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LMO2-202ENST00000395833 SLC35E1Q96K37 410 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 SSX3Q99909 188 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 OPRK1P41145 380 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 FFAR4Q5NUL3 377 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 MISP3Q96FF7 219 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 MGST2Q99735 147 aa23.37■■□□□ 1.33
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LMO2-202ENST00000395833 TEPPQ6URK8 271 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 OR1P1Q8NH06 330 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 CACNG8Q8WXS5 425 aa23.36■■□□□ 1.33
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LMO2-202ENST00000395833 TSPAN15O95858 294 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 ACSM6Q6P461 480 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 SLC25A33Q9BSK2 321 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 RPRMQ9NS64 109 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 VPS13CQ709C8 3753 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 HLA-DRB1P01911 266 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 MFAP2P55001 183 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 NDPQ00604 133 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO2-202ENST00000395833 GAMTQ14353 236 aa23.35■■□□□ 1.33
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