RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 FAM74A3Q4VXF1 159 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 VENTXO95231 258 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 BCL2P10415 239 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 PMS2P11Q13670 270 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 GCSAMLQ5JQS6 135 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 MIC13Q5XKP0 118 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 CLRN3Q8NCR9 226 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 RAB24Q969Q5 203 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 KCNIP2Q9NS61 270 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 FLNCQ14315 2725 aa20.22■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 ZFP92A6NM28 416 aa20.21■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 SEC14L6B5MCN3 397 aa20.21■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 MAS1LP35410 378 aa20.21■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 CD69Q07108 199 aa20.21■□□□□ 0.83
REXO4-201ENST00000371935 A0A1W2PRD5 423 aa20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 A0A1W2PRF3 423 aa20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 A0A1W2PRM7 423 aa20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 DEFA4P12838 97 aa20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 TNXAQ16473 311 aa20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 TMEM144Q7Z5S9 345 aa20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PPP1R27Q86WC6 154 aa20.2■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 IGLC7A0M8Q6 106 aa20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 FBP1P09467 338 aa20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 COMPP49747 757 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 RAB31Q13636 194 aa20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 GAMTQ14353 236 aa20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 SSMEM1Q8WWF3 244 aa20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 P2RX4Q99571 388 aa20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 FBXL15Q9H469 300 aa20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 TACC2O95359 2948 aa20.19■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 ACTL6BO94805 426 aa20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 IFNA1P01562 189 aa20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 SOHLH1Q5JUK2 328 aa20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 RPL29P47914 159 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 B2MP61769 119 aa20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 MLANAQ16655 118 aa20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 STPG3Q8N7X2 389 aa20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 CACNG8Q8WXS5 425 aa20.18■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 MINOS1Q5TGZ0 78 aa20.17■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 SLC16A13Q7RTY0 426 aa20.17■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa20.17■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa20.17■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa20.17■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 FOXH1O75593 365 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 TOX4O94842 621 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PAX6P26367 422 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PRR20EP86478 221 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PRR20CP86479 221 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PRR20DP86480 221 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PRR20BP86481 221 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PRR20AP86496 221 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 TBX15Q96SF7 602 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PIMREGQ9BSJ6 248 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 VAX2Q9UIW0 290 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 AKAP6Q13023 2319 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 OOSP1A8MZH6 123 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 REG1AP05451 166 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 DYNAPQ8N1N2 210 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 ZNF114Q8NC26 417 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 SLC45A2Q9UMX9 530 aa20.16■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PLXNB1O43157 2135 aa20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 GNB1P62873 340 aa20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 SSX2Q16385 188 aa20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 PVRIGQ6DKI7 326 aa20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 TMEM88Q6PEY1 159 aa20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 FAM168AQ92567 244 aa20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 NAV3Q8IVL0 2385 aa20.15■□□□□ 0.82
REXO4-201ENST00000371935 A0A1W2PPV4 95 aa20.14■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 MOSP00540 346 aa20.14■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 LINC00869P0C866 280 aa20.14■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 MMDQ15546 238 aa20.14■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 CBLN2Q8IUK8 224 aa20.14■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 C10orf105Q8TEF2 133 aa20.14■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 SLC35E1Q96K37 410 aa20.14■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 TEX22C9J3V5 150 aa20.13■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 FCN1O00602 326 aa20.13■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 AREGP15514 252 aa20.13■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 LGALS4P56470 323 aa20.13■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 TMEM249Q2WGJ8 235 aa20.13■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 AWAT1Q58HT5 328 aa20.13■□□□□ 0.81
REXO4-201ENST00000371935 NPBQ8NG41 125 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms